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深圳先进院努力瞄准国家战略需求，紧密结合区域创新体系建设，依次建立了面向智能系统与制造装备的“中科院香港中文大学深圳先进集成技术研究所”（由中科院、深圳市、香港中文大学三方共建）；面向低成本健康的“生物医学与健康工程研究所”和面向快速城市化和工业信息化的“先进计算与数字工程研究所”，主要发展“集成工程学”、“健康工程学”、“数字工程学”三大新兴学科，努力打造自主创新的科技高地，形成了多学科交叉、集成创新的特色与优势，科研成果不断涌现。
项目：
截止2010年底，自筹项目经费近4.54亿。科研项目共计511项。973、863、国家重大专项、科技支撑计划、国际科技合作、自然科学基金、中科院、广东省、深圳市和企业合作等项目全面开花。
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国家973重大基础研究计划项目“心脑血管易损斑块的高分辨成像识别与风险评估预警体系重大问题的基础研究”于 2009年9月获得科技部批准立项（经费2800万），实现了落户深圳市的国家重大科学基础研究项目零的突破。
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国家基金项目的录取率达33%，表现了强的基础研究竞争力。
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中科院、广东省、深圳市163项，其中获得深圳市机器人专项，对机器人核心技术研发和产业化给予强有力推动。
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争取157个地方科研和产业化项目，服务企业300余家。
专利:
五年申请累计受理391项，其中发明专利占77％，转化过程中的专利占30％。2009年发明专利申请量列广东省科研院所第一名；2009年获批 “全国企事业单位知识产权试点单位”。
（以上图表数据截止至2009年底）
论文/专著：
先进院学术文章数量与质量位居国内研究所15名之内，成果不断涌现。截止2010年底，共发表论文1197篇，
（以上图表数据截止至2009年底）
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EI论文收录数量在全国科研机构排名约占11位。
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高影响因子文章比例大幅增加
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