由文秘党宣办、运行管理办和基建办组成。其主要职能：
—— 承担院领导秘书工作；牵头负责全院文书档案的规范管理、机要保密、院务会议决定事务的督办；负责党群组织和创新文化的建设，负责对外宣传工作。
—— 牵头负责全院行政资源管理与保障、行政事务服务与管理、重要来访接待工作；负责公共安全工作。
—— 负责西丽园区基本建设工作；配合实验室改造工作。
—— 负责相关制度的制定；负责院理事会秘书处、安全保卫办公室、保密办公室、秘书桥的日常管理工作；负责研究所行政秘书的培养和考核。负责联系中国科学院办公厅、广州分院办公室，联系广东省、深圳市等相关对口单位。
—— 院领导交办的其他工作。